- 26.09.1941 Bauauftrag an GHH u. Werft in Varna* vergeben mit vorgesehener Fertigstellung am 10.09.1942 [5] - Fertigmontage aus Sektionen der Gute-Hoffnung-Hütte [1] * Laut Gröner: Karlovag, Varna.
- 17.09.1942 F 539 nach Abnahmeprobefahrt in Dienst gestellt [3]
- 31.10.1942 In Berdjansk von der 1. Landungsflottille übernommen und der 2. Gruppe der 3. Landungsflottille unter Lt.z.S. Wachs zugeordnet [6]
- 10.11.1942 Gemäß taktischen Gliederung der 2. Gruppe der 3. Landungsflottille zugeteilt [6]
- 15.04.1943 Teilnahme an Geleit „Kleiner Bär 28“ im Rahmen der 3. Landungsflottille [4]
- 01.07.1943 F 539 von 3. Landungsflottille als einsatzbereit bei der 3. Gruppe gemeldet [2]
- 01.09.1943 F 539 bei der 3. L-Flottille gemeldet [2]
- 18./19.09.1943 F 539 mit Geleit 'Hagen 90“ in Anapa bei Angriff von 13 Il-2 beschädigt, Abteilung 3 vollgelaufen, MES ausgefallen, aber noch schwimmfähig. Kurz vor dem Ablegen nochmals 12 Il-2 abgewehrt [2]
- 17.10.1943 Gem. FS ASM G 27777 Qu. vom 22.10.1943 wird F 539 von der 3. Landungsflottille der 7. Landungsflottille zugeteilt [6]
- 20.10.1943 Lt. Meldung der 3. L.-Fl. im Fahrzeugbestand bei der Halbflottille Feodosia [2]
- 25.10.1943 Varna: Übernahme von F 539 in die 7. Landungsflottille [7]
- 01.12.1943 Bei der 4. Gruppe der 7. Landungsflottille gemeldet [7]
- 16.02.1944 Bei der 4. Gruppe der 7. Landungsflottille gemeldet [7]
- 09.04.1944 F 539, F 579 (7.L-Flottille) verlassen zusammen mit F 445 (1. L-Flottille) als letzte Boote Odessa, nachdem das Sprengkommando an Bord genommen wurde. [7]
- 25./26.04.1944 F 539 von Constanta nach Sewastopol. Unterwegs Uboot abgewehrt [2]
- 26.04.1944 F 142, F 374, F 539 von Constanta aus, wegen Wetterlage wieder ein [2]
- 28.-30.04.1944 F 372, F 469, F 471, F 539 von Constanta nach Sewastopol [2]
- 03.-05.05.1944 Im Geleit "Freya" von Sewastopol nach Konstanza [8].
- 07.-11.05.1944 Verstärkung für Geleit "Parzival" von Konstanza nach Chersones und zurück [5]
- 07.05.1944 21u40 Mit Geleit F 122 von Konstanza nach Sewastopol. Ladung: 1 Sturmgeschütz, 75 t Munition, 20 Sauerstoffflaschen [5]
- 09.05.1944 05u15 Mit Geleit F 122 vor Chersones eingetroffen [5]
- 10.05.1944 11u30 MK 5164 wegen Seeschäden nach Übernahme von Besatzung und Waffen auf Pos. 44°11'N 31°13'O mit Artillerie [selbst]versenkt [2].
- 11.05.1944 08u30 Mit Geleit F 122 in Konstanza ein [2].
- 31.05.1944 Bei der 4. Gruppe der 7. Landungsflottille gemeldet [7]
- 01.09.1944 Verlust durch Artillerietreffer bei Gruia (Donau) [G]
Verlust am: 01.09.1944Verlustort: nahe Gruia / DonauVerlustart: gesunkenVerlustursache: ArtillerietrefferMannschaftsschicksal: ? Tote